Rencana pembangunan Gereja Bethany di jalan Thamrin, Kelurahan Bangunsari, Kecamatan Ponorogo mendapat penolakan. Sebuah spanduk bertuliskan ummat islam dari beberapa RT di Bangunsari pun terpampang sebagai bentuk penolakan. Berikut kutipan berita yang diperoleh dari situs Cakrawala.co, Sumber: https://cakrawala.co/warga-di-ponorogo-menolak-rencana-pendirian-pembangunan-gereja-bethany/
Bersumber dari Jambi Express, 17 November 2013, dalam berita berjudul, “Warga Minta Gereja Dibongkar”. Warga RT 19 Kelurahan Bagan Pete, Kecamatan Kota Baru Jambi, meminta agar gereja yang telah dibangun di pemukiman mereka segera dibongkar. Pasalnya, warga menolak keberadaan gereja tersebut, karena tidak ada izin dari masayarakat dan juga Izin Mendirikan Bangunan (IMB). Selain itu, warga juga tidak mengetahui kalau bangunan tersebut akan dijadikan tempat ibadah, karena pada saat awal pembangunan, pihak pembangun menjelaskan bangunan tersebut hanya digunakan sebagai tempat
Sebuah tuduhan terhadap gereja bahwa gereja tidak memiliki ijin kembali terjadi. Kali ini adalah Gereja HKBP Setu yang dibongkar oleh Pemkab Bekasi dengan menggunakan kekuatan Satpol PP. Kita tahu beberapa daerah yang di Indonesia bergerak menjadi anti kristen, berbagai upaya menutup gereja di daerah tersebut terus terjadi dengan berbagai alasan. Bahkan gereja yang sudah ada ijinnya pun dengan mudahnya ditutup. Berikut adalah beberapa himpunan berita terkait mengenai penutupan dan pembongkaran gereja HKBP Setu Bekasi.
Dikutip dari Tempo Interaktif, 16 Mei 2011, acara ucap syukur sekaligus perayaan Paskah di Cirebon dibubarkan paksa sekelompok orang yang menamakan diri Gerakan Anti Pemurtadan dan Aliran Sesat (Gapas) Senin 16 Mei 2011. Perayaan yang dilakukan di Gedung Gratia Cirebon itu diikuti sekitar 6.000 jamaah yang sebagian besar terdiri dari anak usia SD hingga SMA. Namun sekitar pukul 18. 15 WIB ormas Gapas yang terdiri sekitar 20 orang dipimpin Andi Mulya mendatangi gedung tersebut. Mereka pun langsung menghardik panitia penyelenggara
Setelah sebelumnya pintu gerbang GKI Yasmin kembali digembok (baca:Pintu Gerbang GKI Yasmin Kembali Digembok), kini semakin jelas usaha Pemkot Bogor untuk menyingkirkan keberadaan Gereja GKI Yasmin. Berikut kutipan berita nya dari Jawaban.com Hal seperti inilah yang terjadi jika jiwa toleransi beragama mulai luntur yang disokong dengan kekuatan hukum kepentingan dan pengerahan aparat keamanan secara sistematis. Sangat jelas dinyatakan juga diberitakan bahwa pada putusan Mahkamah Agung (MA) Nomor 127 PK/TUN/2009, Ijin Mendirikan Bangunan (IMB) Gereja Kristen Indonesia (GKI) Taman Yasmin Bogor